这里强调另一个需要乙肝患者注意的问题：除了传染性之外，更需要关注肝脏的受损程度。
可以这样说，传染性更多提示的是对别人的危害，而肝脏的受损程度才反映的是患者自己病情的严重状况。
肝脏的受损程度越严重，发生肝硬化和肝癌的风险越高。上面提到的HBV-DNA只是检查乙肝病毒的复制量，但DNA复制程度的大小并不代表肝脏实际损害的程度。DNA复制程度高，有可能肝脏并没有发生严重的炎症；相反，DNA复制程度低，肝脏却可能已经发生了炎症和纤维化。
肝脏穿刺活检才是判断肝脏炎症和纤维化程度的“金标准”。但考虑很多人对创伤性检查的接受程度低，且创伤性检查存在出血、感染等并发症风险，所以目前相关指南越来越推荐采用无创检查方法（如肝脏瞬时弹性硬度测定）来代替肝穿刺活检，以判断肝脏损伤的严重程度。
很多人都觉得“小三阳”比“大三阳”好，因为病毒少一些，传染性小一些，但慢性乙肝患者大多又都听过“小三阳”更容易转变成肝癌这种说法。
其实这两种观点都有道理，但也都太过绝对。确实，肝癌患者中“小三阳”的比例比“大三阳”要高得多，一方面有基数大的原因，乙肝人群中“小三阳”的数量本身就远超“大三阳”；另一方面，“大三阳”患者因为传染性强，重视程度高，所以随访积极、治疗及时，而很多“小三阳”患者长期病毒稳定，症状不明显，但其中有部分患者的肝脏已经发生了炎症破坏甚至肝硬化，等到症状出现时很可能已经发展成肝癌了。
所以，除了HBV-DNA检测病毒外，乙肝患者还需要随访肝功能和肝脏瞬时弹性硬度测定来了解肝脏的受损程度。另外，超声可以判断有无肝硬化、早期发现肝癌病灶，血清甲胎蛋白（AFP）可以作为肝癌的肿瘤标志物进行早期筛查。
