遗传因素：最多见，如胎儿染色体异常、遗传基因存在缺陷，导致胚胎不能继续发育，这也是人类的一种自然选择机制。

内分泌因素：激素分泌不足难以支持胚胎发育而造成死亡，如黄体功能不全；糖尿病、甲状腺功能障碍等。

免疫因素：如抗心磷脂抗体综合征、系统性红斑狼疮等免疫功能紊乱，导致胚胎停止发育。

子宫因素：子宫腔畸形如单角子宫、子宫纵膈、宫腔粘连等使得胚胎无法生长。

感染性疾病：孕期病毒感染、如风疹病毒，巨细胞病毒等。

物理因素：早孕期接触放射性物质、有毒的化学制剂、高温、过度受刺激等。

染色体检查：由于胚胎染色体异常是胚胎停止发育最常见的原因，胎停患者在流产时进行流产胚胎组织染色体检测，根据检查结果可进一步检查夫妻双方染色体核型分析。

解剖结构检查，胎停后进行超声检查，明确子宫发育有无异常、有无子宫肌瘤或子宫腺肌病、是否存在盆腔病变（输卵管积水、卵巢囊肿）等。

女性内分泌检查：月经第2天或第3天进行激素水平检查，排卵后第7～12天检测孕激素水平。此外，还应检测甲功三项及空腹血糖，必要时行糖耐量试验。

免疫病因检查：包括抗磷脂抗体；封闭抗体检查；对于诊断为抗磷脂综合征患者进行抗核抗体、抗双链DNA 抗体等检查；原因不明确的复发性流产患者进行自身抗体筛查，如抗甲状腺抗体、抗精子抗体、抗卵巢抗体等检查。

血栓前状态检查：凝血功能相关检查；同型半胱氨酸（Hcy）；蛋白C、蛋白S、Ⅻ因子、抗凝血酶Ⅲ（AT-Ⅲ）；血栓弹力图；双侧子宫动脉血流等。